More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0300 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  49.3 
 
 		 318 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  44.37 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  45.73 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  47.25 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  44.18 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  44.7 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  45.76 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  45.74 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  42.95 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  42.81 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  44.55 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  46.33 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  41.35 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  43.77 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  47.89 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  47.89 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  45.99 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  47.54 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  43.52 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  44.71 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  42.28 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  44.56 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  43.14 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  41.67 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  40.74 
 
 		 338 aa  215  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  44.91 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  43.6 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  43.6 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  42.62 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  44.1 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  41.28 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  41.61 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  42.51 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  39.94 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  44.53 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.94 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  38.35 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.81 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  39.49 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  41.7 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  44.37 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  41.7 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  41.7 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  37.3 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  37.72 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  40.07 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  37.13 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  39.31 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  37.13 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  42.53 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  38.66 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  41.08 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  40.13 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  36.42 
 
 		 408 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.28 
 
 		 352 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  45.65 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  44.52 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  37.54 
 
 		 375 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  39.79 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  38.99 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.24 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.15 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  35.25 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  38.76 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  29.81 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  35.82 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 		 517 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.69 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  27.83 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  26.99 
 
 		 433 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.41 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  25.6 
 
 		 742 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  26.59 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  28.33 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.7 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.85 
 
 		 751 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1818 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  27.4 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.35 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.14 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.86 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  29.35 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.35 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  29.84 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  26.29 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  26.82 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.03 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.05 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>