More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4245 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  35.84 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  33.68 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 		 358 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 303 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  31.86 
 
 		 351 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  32.39 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.21 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.03 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  35.37 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  32.53 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  32.14 
 
 		 384 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  32.53 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  31.96 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.98 
 
 		 337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  31.95 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  36.32 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  32.97 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  35.86 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  34.88 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  30.38 
 
 		 409 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  34.68 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  31.79 
 
 		 330 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.4 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.7 
 
 		 408 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  30.51 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  33.48 
 
 		 390 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.56 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.24 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  36.53 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  29.81 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  32.05 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  32.61 
 
 		 384 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  33.78 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  35.35 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.74 
 
 		 517 aa  99  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  35.32 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  35.35 
 
 		 341 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  34 
 
 		 325 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  32.14 
 
 		 624 aa  98.6  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  33.49 
 
 		 336 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  30.59 
 
 		 341 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  36.18 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  33.78 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.62 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  31.6 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  31.2 
 
 		 605 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  27.8 
 
 		 377 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  35.93 
 
 		 325 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  35.18 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  31.84 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.85 
 
 		 826 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  38.19 
 
 		 317 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  29.6 
 
 		 349 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  30.72 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  29.6 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  36.9 
 
 		 351 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  29.6 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  31.7 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.04 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 		 554 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  31.92 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  29.2 
 
 		 349 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  31.02 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.24 
 
 		 751 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  29.2 
 
 		 349 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 		 348 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.08 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 829 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.71 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  34.64 
 
 		 517 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 861 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  29.77 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  33.71 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.97 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.72 
 
 		 892 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.39 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  28.29 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>