More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0932 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 338 aa  697    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  57.19 
 
 		 349 aa  364  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.04 
 
 		 367 aa  332  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  50.47 
 
 		 409 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  50.59 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  50.59 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  51.4 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  51.4 
 
 		 384 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  49.53 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  51.08 
 
 		 384 aa  315  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  50.77 
 
 		 375 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  52.87 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  49.23 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  50.32 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  50.8 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  48.6 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  50.65 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  50.32 
 
 		 301 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  48.71 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  50.8 
 
 		 295 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  50.96 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  48.56 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  49.02 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  49.04 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  49.2 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  47.92 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  47.02 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  50.16 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  50 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  46.86 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  45.89 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  48.88 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  48.26 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 		 303 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  47.15 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  50.16 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  51.61 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  48.55 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  48.36 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  48.4 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  46.33 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  49.2 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  46.1 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  49.68 
 
 		 291 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  44.18 
 
 		 329 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  49.68 
 
 		 291 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  46.1 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  48.36 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  48.03 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  48.03 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  46.6 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  46.28 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  45.31 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  46.89 
 
 		 290 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  44.01 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  43.55 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  42.33 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  42.27 
 
 		 287 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  43.09 
 
 		 318 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  39.2 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  40.13 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  39.31 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  42.52 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  38.71 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  38.92 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  38.92 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  38.92 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  38.29 
 
 		 349 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  37.97 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  39.13 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  38.44 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 		 259 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.24 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.53 
 
 		 751 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.81 
 
 		 586 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.91 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.59 
 
 		 742 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.02 
 
 		 826 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  35 
 
 		 517 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 829 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  33.12 
 
 		 614 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  34.08 
 
 		 517 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.89 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.44 
 
 		 510 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  33.53 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  35.37 
 
 		 259 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.02 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  38.29 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 861 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.03 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 416 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  37.27 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.06 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.67 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.88 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  40.66 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>