More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3335 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  57.99 
 
 
301 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.81 
 
 
308 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  56.13 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  52.26 
 
 
319 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  52.33 
 
 
351 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  51.12 
 
 
303 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.79 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  48.12 
 
 
312 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.09 
 
 
367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  45.83 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  48.66 
 
 
337 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  44.25 
 
 
324 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  42.8 
 
 
351 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 
338 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  44.81 
 
 
290 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  41.55 
 
 
375 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  40.5 
 
 
384 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  44.44 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  41.61 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  44.33 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  44.44 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  39.59 
 
 
409 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  41.24 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  41.24 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  42.46 
 
 
307 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  41.3 
 
 
390 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  40.73 
 
 
330 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  39.59 
 
 
384 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  41.88 
 
 
300 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  40.57 
 
 
332 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  42.7 
 
 
301 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  41.28 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  41.48 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  39.66 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  42.76 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  39.25 
 
 
408 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  41.49 
 
 
334 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  39.85 
 
 
331 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  39.86 
 
 
325 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  39.59 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  44.74 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  42.91 
 
 
294 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  41.13 
 
 
337 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  40.28 
 
 
310 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  38.03 
 
 
319 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  39.71 
 
 
308 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  40.41 
 
 
341 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  40.44 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  42.2 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  40.28 
 
 
351 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  43.4 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  40.37 
 
 
287 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  42.71 
 
 
325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  40.29 
 
 
291 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  40.61 
 
 
324 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  40.29 
 
 
311 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  40.81 
 
 
341 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  40.08 
 
 
349 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  44.74 
 
 
291 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  40.33 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40.08 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  44.74 
 
 
291 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.08 
 
 
349 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  40.08 
 
 
347 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  39.48 
 
 
329 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.67 
 
 
349 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  39.67 
 
 
361 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  38.77 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  40.29 
 
 
336 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  39.37 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  37.45 
 
 
826 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.09 
 
 
742 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  43.07 
 
 
306 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  37.22 
 
 
433 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  35.88 
 
 
352 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  37.36 
 
 
325 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  37.31 
 
 
510 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  36.86 
 
 
309 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  35.61 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.09 
 
 
586 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.37 
 
 
751 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  35.4 
 
 
517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.5 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.83 
 
 
348 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  34.12 
 
 
614 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 
829 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 
517 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  39.77 
 
 
398 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 
398 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 
259 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
293 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  35.5 
 
 
314 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
861 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  35.21 
 
 
316 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  33.09 
 
 
267 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
1818 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.96 
 
 
390 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  36.7 
 
 
454 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>