More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00725 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  100 
 
 		 454 aa  948    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  70.09 
 
 		 464 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  65.25 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  41.67 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  37.26 
 
 		 491 aa  276  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  51.15 
 
 		 344 aa  246  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  52.56 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  53.27 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  45.58 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  33.24 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  33.56 
 
 		 420 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  31.56 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  32.71 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  33.91 
 
 		 548 aa  109  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  36.7 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  34.57 
 
 		 312 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 308 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  46.09 
 
 		 532 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 		 319 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  35.87 
 
 		 398 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.99 
 
 		 325 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.95 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1911 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.17 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  32.34 
 
 		 301 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 319 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  35.36 
 
 		 965 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.91 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  31.75 
 
 		 292 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  46.55 
 
 		 566 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  29.13 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  35.08 
 
 		 960 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  37.11 
 
 		 751 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  34.74 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  30.88 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.12 
 
 		 826 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.47 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  34.1 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.17 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.3 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.3 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.25 
 
 		 742 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  31.09 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  34.03 
 
 		 295 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  33.68 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.66 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.9 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.84 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  31.43 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.02 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.69 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  31.25 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  36.13 
 
 		 1049 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  31.96 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35.98 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 		 1007 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.61 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  34.07 
 
 		 1049 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  29.9 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.79 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  30.05 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  30.43 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  32.79 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1200 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  30.77 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  34.07 
 
 		 923 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  32.87 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  32.87 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  31.47 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  31.28 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  31.28 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 		 1186 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.14 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.29 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  30.5 
 
 		 957 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.57 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  32.12 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 1818 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 		 1053 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  32.26 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>