More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0483 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 427 aa  894    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  44.99 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  41.1 
 
 		 454 aa  342  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  43.29 
 
 		 458 aa  334  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  39.92 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  37.12 
 
 		 491 aa  293  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  53.78 
 
 		 344 aa  259  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  38.29 
 
 		 369 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  52.53 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  54.09 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  35.02 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  35.63 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  33.46 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  27.16 
 
 		 566 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  27.25 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  24.51 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  25.86 
 
 		 334 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  33.18 
 
 		 332 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  26.4 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.47 
 
 		 351 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  27.61 
 
 		 563 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.65 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 		 276 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.35 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.98 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  41.38 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  30.73 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.96 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 		 308 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  33.16 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  31.28 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  25.26 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  32 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  25.57 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  31.79 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1911 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  31.22 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.9 
 
 		 751 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  30.73 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  23.81 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  25.53 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  32.63 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  31.77 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  31.77 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.5 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  32.29 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  37.04 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  28.78 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  24.74 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  31.58 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.5 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 861 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  31.07 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  31.12 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.13 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.17 
 
 		 826 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  32.81 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  30.88 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  36.13 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  32.57 
 
 		 960 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  36.13 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  30.88 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  28.09 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  28.65 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  31.09 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  30.26 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  30.7 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  31.12 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  35.58 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  29.49 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.47 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  30.48 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  32.18 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  34.9 
 
 		 862 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  29.11 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.52 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.55 
 
 		 922 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  24.53 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 		 1007 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  24.53 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>