More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4948 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
349 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.13 
 
 
510 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  31.1 
 
 
286 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
861 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  32.66 
 
 
253 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  29.73 
 
 
413 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  33.22 
 
 
251 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 
273 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  28.48 
 
 
263 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  25.88 
 
 
633 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  25.51 
 
 
356 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.32 
 
 
481 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.09 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  27.42 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.18 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.1 
 
 
384 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.18 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  37.37 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.36 
 
 
614 aa  89.4  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.3 
 
 
417 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 
657 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  28.99 
 
 
766 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  26.16 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.07 
 
 
654 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
1818 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  31.77 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  25.96 
 
 
616 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  27.84 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 
1186 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
611 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.43 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  28.57 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  27.56 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  29.03 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  33.55 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  26.87 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 
621 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  30.6 
 
 
586 aa  79.7  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  26.51 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
698 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  27.65 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  29.34 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  27.85 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.84 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  29.62 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  31.77 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  32.06 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  29.13 
 
 
427 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  28.71 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  28.77 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.95 
 
 
444 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  28.11 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 
455 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.99 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
842 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  28.99 
 
 
957 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  27.72 
 
 
1200 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  29.76 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  26.47 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.79 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  23.68 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  31.53 
 
 
1064 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.96 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  28.17 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.47 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.26 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  32.46 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  31.16 
 
 
437 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  28.71 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  29.76 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.39 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.7 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  25.09 
 
 
877 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  28.98 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  27.18 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  32.16 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  31.46 
 
 
960 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  27.52 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  27.98 
 
 
1049 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  26.36 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.08 
 
 
922 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.32 
 
 
742 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  29.32 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
1007 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  24.65 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  29.38 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>