More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0383 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
455 aa  939    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  45.81 
 
 
427 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  41.67 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  40 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  41.83 
 
 
458 aa  305  9.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  51.79 
 
 
344 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  43.18 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  50 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  51.6 
 
 
377 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  49.1 
 
 
369 aa  218  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  35.21 
 
 
396 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  33.68 
 
 
420 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  31.97 
 
 
395 aa  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  32.07 
 
 
510 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  47.41 
 
 
548 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  45.24 
 
 
566 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
367 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
308 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  30.58 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  44.35 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 
319 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.67 
 
 
319 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.65 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  30.88 
 
 
304 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  31.55 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.17 
 
 
325 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  33.16 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  29.7 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  31.86 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.8 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  30.39 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  33.74 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  28.42 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.35 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.19 
 
 
327 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  30.1 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.27 
 
 
1911 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  39.01 
 
 
563 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
303 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
259 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  28.86 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.02 
 
 
922 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.51 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.66 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  28.92 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  31.9 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  28.78 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.21 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.93 
 
 
277 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  32.74 
 
 
960 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  35.37 
 
 
291 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  32.67 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.94 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.09 
 
 
1581 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  35.37 
 
 
291 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.48 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.56 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.74 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  31.43 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  29.23 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  28.86 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
861 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 
1049 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 
1186 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  29.91 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  30.54 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  32.16 
 
 
1049 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.65 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.35 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  28.5 
 
 
421 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
751 aa  67  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.82 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  32.21 
 
 
338 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  28.5 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  28.35 
 
 
318 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  29.38 
 
 
308 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 
517 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  26.19 
 
 
273 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  28.97 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
617 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  28.94 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 
267 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>