More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3794 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  36.25 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 
740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  31.71 
 
 
349 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.44 
 
 
412 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
882 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.77 
 
 
442 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.01 
 
 
325 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
861 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
293 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.78 
 
 
1911 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.72 
 
 
527 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.91 
 
 
517 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  28.31 
 
 
269 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.9 
 
 
338 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  30.04 
 
 
522 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.5 
 
 
586 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  28.9 
 
 
517 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  27.17 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  30.38 
 
 
766 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  36.55 
 
 
491 aa  99  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.04 
 
 
751 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.94 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 
426 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
367 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.01 
 
 
416 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  31.91 
 
 
862 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.01 
 
 
416 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.86 
 
 
925 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.32 
 
 
444 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.43 
 
 
614 aa  94.4  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  29.59 
 
 
413 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  29.07 
 
 
356 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29 
 
 
538 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.69 
 
 
348 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
475 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.44 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  31.07 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.12 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.31 
 
 
468 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 
398 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.52 
 
 
586 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 
398 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  38.73 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.56 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  31.05 
 
 
892 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.04 
 
 
826 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  30.11 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  29.43 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  28.88 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  29.58 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  31.02 
 
 
636 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  31.06 
 
 
657 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
621 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 
523 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.15 
 
 
433 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27.94 
 
 
664 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  30.62 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
617 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.84 
 
 
554 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  30.04 
 
 
491 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.72 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.61 
 
 
616 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.85 
 
 
416 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
509 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  28.52 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  30.38 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  27.96 
 
 
556 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  29.52 
 
 
633 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  30.64 
 
 
654 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  26.1 
 
 
369 aa  86.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  26.88 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.28 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  26.52 
 
 
1104 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  28.11 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.11 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  29.6 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.57 
 
 
929 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 
351 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  36.42 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.09 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  36.42 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  27 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
620 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
637 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.52 
 
 
654 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  27.44 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  36.42 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  35.68 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  27.64 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.26 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  36.78 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>