More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0809 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  100 
 
 
458 aa  955    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  65.25 
 
 
454 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  64.85 
 
 
464 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  43.29 
 
 
427 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  40.89 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  37.14 
 
 
491 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  52.05 
 
 
377 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  48.28 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  49.55 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  43.75 
 
 
369 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  35.64 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  34.67 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  31.56 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  33.04 
 
 
548 aa  96.7  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
308 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  91.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  33.51 
 
 
259 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  31.28 
 
 
301 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  24.94 
 
 
331 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  36.94 
 
 
751 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  35.52 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  34.07 
 
 
965 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.84 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  34.21 
 
 
1049 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  33 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.28 
 
 
277 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.25 
 
 
742 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.91 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  31.44 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.88 
 
 
1911 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  43.1 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  29.7 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.6 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.28 
 
 
952 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  37.3 
 
 
1049 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.23 
 
 
292 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.34 
 
 
325 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 
319 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  29.68 
 
 
322 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  31.03 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.16 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  31.55 
 
 
276 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  28.44 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.98 
 
 
826 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  32.98 
 
 
960 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.69 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  30.2 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 
1007 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  43.59 
 
 
566 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  31.75 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  30.73 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.69 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.61 
 
 
829 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  28.22 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  26.57 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.35 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  26.57 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  29.56 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 
1160 aa  73.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  29.79 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  30.89 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  35.48 
 
 
1581 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  32.04 
 
 
923 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  32.26 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.76 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  29.72 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  30.27 
 
 
253 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  27.13 
 
 
766 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.04 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  29.72 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.99 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.82 
 
 
517 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
861 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  33.86 
 
 
929 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 
1186 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  29.72 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  32.28 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1818 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.43 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  29.67 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 
775 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  32.81 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  27.06 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.94 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  32.58 
 
 
1200 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>