183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4062 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
532 aa  1097    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  39.96 
 
 
510 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  38.46 
 
 
566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  39.41 
 
 
548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  39.89 
 
 
563 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  32.44 
 
 
395 aa  238  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  42.63 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  37.31 
 
 
396 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  51.09 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  34.01 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  46.09 
 
 
454 aa  93.6  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 
356 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  40 
 
 
491 aa  90.5  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  36.15 
 
 
344 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  43.7 
 
 
464 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  41.38 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  44.35 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  43.1 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2099  hypothetical protein  27.27 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0544192  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  26.83 
 
 
369 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  31.72 
 
 
330 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 
351 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  34.06 
 
 
377 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  34.06 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.31 
 
 
301 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
308 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 
358 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  37.27 
 
 
312 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  32.12 
 
 
409 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  34.51 
 
 
319 aa  57  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  37.72 
 
 
751 aa  57  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  32.37 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
349 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.09 
 
 
303 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  38.1 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
303 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.73 
 
 
291 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  33.02 
 
 
304 aa  54.3  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.32 
 
 
338 aa  53.9  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
637 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  29.5 
 
 
332 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 
740 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  29.83 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  32.12 
 
 
408 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.48 
 
 
325 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.84 
 
 
398 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.3 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  30.08 
 
 
300 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
276 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 
329 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 
1049 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  37.04 
 
 
384 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 
358 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 
570 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.78 
 
 
657 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  29.68 
 
 
263 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  32.23 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.57 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 
628 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  33 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  36.27 
 
 
923 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  30.82 
 
 
603 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  28.21 
 
 
296 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  32.81 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  33.02 
 
 
535 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  35.78 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0887  protein of unknown function DUF323  26.29 
 
 
267 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  35.19 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  32.03 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
617 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.58 
 
 
1911 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.88 
 
 
287 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  32.03 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.17 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  27.16 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  28.03 
 
 
253 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  33.08 
 
 
351 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.96 
 
 
600 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.96 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 
1104 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 
1160 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  31.43 
 
 
551 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  34.58 
 
 
527 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.09 
 
 
319 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
1043 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
287 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.09 
 
 
826 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  26.55 
 
 
742 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  32.41 
 
 
324 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 
323 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  35.78 
 
 
1053 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
623 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.2 
 
 
327 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>