105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2099 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2099  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  947    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0544192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  27.76 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  27 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  25.42 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  25.15 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  23.63 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  25.22 
 
 		 1190 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  28.41 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  30.13 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1200 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  27.37 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  25.82 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  26.12 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  27.08 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  23.55 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  22.31 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  27.54 
 
 		 1049 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  28.14 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  27.02 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0078  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 872 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  23.05 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  24.68 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  26.41 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  26.41 
 
 		 291 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  26.41 
 
 		 291 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  25.46 
 
 		 338 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 		 1160 aa  53.9  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  25.18 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.85 
 
 		 276 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  20.91 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  23.51 
 
 		 351 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.21 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  24.91 
 
 		 965 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  24.03 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  25.32 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  24.77 
 
 		 1049 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  24.45 
 
 		 960 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  25.11 
 
 		 923 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  25.76 
 
 		 1053 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  23.27 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  22.22 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.15 
 
 		 319 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  26 
 
 		 240 aa  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 		 775 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  28.36 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 		 1201 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.85 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30.88 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  27.65 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  20.51 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.85 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  26.94 
 
 		 1007 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  24.16 
 
 		 263 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  23.79 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  27.07 
 
 		 1186 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  24.14 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  23.34 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  23.53 
 
 		 318 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  25.23 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  24.07 
 
 		 751 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  25.79 
 
 		 957 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  23.98 
 
 		 600 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  23.98 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  23.32 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.83 
 
 		 1023 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  25.89 
 
 		 1064 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1911 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.72 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  25.74 
 
 		 952 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  24.15 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.41 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  23.46 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  23.65 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 842 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  22.94 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  23.79 
 
 		 331 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  22.36 
 
 		 294 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  23.75 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.41 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.93 
 
 		 829 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  27.68 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  23.47 
 
 		 556 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  24.83 
 
 		 246 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  29.41 
 
 		 781 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.37 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  23.76 
 
 		 551 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>