229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3694 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 420 aa  874    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  67.54 
 
 		 420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  55.56 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  45.37 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  38.96 
 
 		 510 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  40.05 
 
 		 566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  40.62 
 
 		 548 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  42.22 
 
 		 563 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  32.54 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  33.96 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  29.46 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  50.35 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  30.73 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  31.6 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  33.67 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  32.46 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  30.99 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  25.96 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  25.65 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  25.89 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  27.22 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  25.33 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  25.32 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  25.32 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  24.73 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  24.93 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  25.67 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  26.1 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  27.05 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.6 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  26 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  26.56 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  25.76 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  24.3 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  23.82 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1911 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  25.55 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  24.66 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  26.17 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  23.97 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  25.07 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  25.21 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.64 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  30 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  23 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.48 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  24.66 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  30.98 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  23.69 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  25.9 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  24.73 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  22.6 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1200 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 		 1104 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  24.44 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  23.95 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.97 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.21 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  24.15 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  21.96 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  30.6 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  23.63 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  30.88 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.94 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  22.82 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  26.8 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  23.84 
 
 		 742 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  24.32 
 
 		 267 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  30.39 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  30.39 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  23.87 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  29.83 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  23.96 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  22.35 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  29.67 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  30.88 
 
 		 559 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.94 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  27.75 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.02 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  24.37 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  27.12 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  28.96 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  30.94 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  27.42 
 
 		 668 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>