More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0945 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  758    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  70.89 
 
 
356 aa  428  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  66.13 
 
 
386 aa  401  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  69.01 
 
 
341 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  68.47 
 
 
330 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  63.47 
 
 
361 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  55.7 
 
 
381 aa  355  5.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  75.25 
 
 
201 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  40.5 
 
 
559 aa  179  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  33.55 
 
 
366 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  36.07 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  35.07 
 
 
663 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  36.57 
 
 
772 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  30.11 
 
 
310 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  31.84 
 
 
760 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  34.4 
 
 
276 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  30.45 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  30.53 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  31.3 
 
 
225 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  32.22 
 
 
263 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  32.43 
 
 
282 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  30.92 
 
 
226 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
715 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  32.35 
 
 
539 aa  109  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  31.3 
 
 
225 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  31.3 
 
 
226 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  30.42 
 
 
226 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  36.49 
 
 
245 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  32.39 
 
 
289 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  30.62 
 
 
768 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  32.82 
 
 
230 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  40.38 
 
 
1581 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  32.62 
 
 
301 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  31.37 
 
 
224 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  30.23 
 
 
298 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  40 
 
 
475 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  35.33 
 
 
279 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.73 
 
 
223 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.61 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  40.8 
 
 
517 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  36.53 
 
 
287 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  41.98 
 
 
586 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  41.1 
 
 
742 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  36.19 
 
 
233 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.62 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.76 
 
 
1911 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.24 
 
 
952 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  38.27 
 
 
293 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  38.8 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  27.99 
 
 
1132 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  28.93 
 
 
287 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  37.84 
 
 
446 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
882 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  36.32 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  36.32 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 
262 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  39.51 
 
 
751 aa  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 
538 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  38.41 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  31.5 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  25.97 
 
 
358 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  31.92 
 
 
237 aa  86.7  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
308 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  29.39 
 
 
296 aa  86.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 
270 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  30.06 
 
 
611 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  38.54 
 
 
826 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.89 
 
 
668 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  40.36 
 
 
829 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  37.42 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  36.21 
 
 
929 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  26.87 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.97 
 
 
922 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  37.57 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  37.93 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  29.1 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.5 
 
 
892 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  27 
 
 
416 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  32.62 
 
 
527 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  35.96 
 
 
862 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
1186 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 
654 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  36.75 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.73 
 
 
740 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  34.3 
 
 
603 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 
1104 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  26.62 
 
 
1196 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  33.53 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  33.14 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  24.73 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>