More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2239 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  679    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  65.61 
 
 
356 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  68.47 
 
 
370 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  64.24 
 
 
361 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  62.28 
 
 
341 aa  354  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  59.47 
 
 
381 aa  348  7e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  64.13 
 
 
386 aa  342  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  74.13 
 
 
201 aa  262  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  40.9 
 
 
559 aa  189  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  34.69 
 
 
366 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  37.63 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  31.68 
 
 
310 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  32.98 
 
 
663 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  33.57 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  33.8 
 
 
772 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  30.15 
 
 
225 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.89 
 
 
226 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
715 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  27.31 
 
 
226 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  31.06 
 
 
289 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  28.73 
 
 
226 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  29.78 
 
 
214 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  31.79 
 
 
760 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  29.04 
 
 
225 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  37.74 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  30.15 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
223 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  33.58 
 
 
539 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  33.18 
 
 
233 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  32.43 
 
 
245 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  29.89 
 
 
224 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  30.72 
 
 
327 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.41 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  39.2 
 
 
742 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.36 
 
 
325 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 
768 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.79 
 
 
826 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.73 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38.6 
 
 
1581 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 
267 aa  89.7  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  30.48 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 
398 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  34.32 
 
 
287 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  38.6 
 
 
276 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.1 
 
 
517 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.83 
 
 
586 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  34.94 
 
 
922 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  40 
 
 
338 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  29.3 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  28.09 
 
 
453 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 
262 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.63 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  32.1 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.07 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.42 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  29.1 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.36 
 
 
1104 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  37.28 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.83 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.13 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.28 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  31.79 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.81 
 
 
829 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  35.76 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  26.61 
 
 
664 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 
654 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  35.22 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.87 
 
 
751 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.43 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.63 
 
 
1196 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  36.42 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  36.25 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 
740 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
882 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
639 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
639 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.43 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  27.76 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  24.38 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  35.52 
 
 
636 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  45.26 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  26.91 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.59 
 
 
1911 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  29.91 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  28.62 
 
 
877 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
1132 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.5 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.14 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  32.37 
 
 
1064 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.24 
 
 
517 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>