262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0571 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  100 
 
 
760 aa  1571    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  51.44 
 
 
772 aa  690    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  52.96 
 
 
663 aa  642    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  40.3 
 
 
539 aa  326  8.000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  45.19 
 
 
329 aa  197  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  164  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  34.6 
 
 
341 aa  124  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  33.96 
 
 
356 aa  120  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 
489 aa  114  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  31.2 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  32.27 
 
 
224 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  36 
 
 
361 aa  104  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  42.17 
 
 
201 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  35.5 
 
 
381 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
327 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.97 
 
 
768 aa  101  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  33.06 
 
 
276 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  32.48 
 
 
230 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  28.52 
 
 
276 aa  98.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  31.43 
 
 
330 aa  97.4  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  30.2 
 
 
285 aa  97.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 
289 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  29.36 
 
 
282 aa  95.1  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.04 
 
 
336 aa  94.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  29.84 
 
 
225 aa  94  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  25.51 
 
 
559 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 
740 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  27.6 
 
 
802 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  30.04 
 
 
245 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
223 aa  91.3  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 
346 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  26.58 
 
 
226 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 
269 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
358 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
263 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  33.76 
 
 
386 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 
270 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
617 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
715 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.5 
 
 
922 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  29.44 
 
 
233 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  27.43 
 
 
226 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  25.74 
 
 
226 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.42 
 
 
1104 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.2 
 
 
267 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  28.63 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.97 
 
 
952 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  26.86 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  25.38 
 
 
287 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  29.71 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28 
 
 
820 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  26.61 
 
 
214 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  25.07 
 
 
1518 aa  81.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.08 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.77 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.18 
 
 
584 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 
639 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 
639 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 
321 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  28.34 
 
 
294 aa  79  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  27.9 
 
 
587 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
618 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  27.51 
 
 
929 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.2 
 
 
636 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 
319 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
882 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  28.33 
 
 
262 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
620 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  39.74 
 
 
301 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  27.39 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  27.85 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  26.46 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  25.83 
 
 
654 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  26.46 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  25.53 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
623 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
621 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.25 
 
 
892 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.9 
 
 
1196 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 
593 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
554 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  26.88 
 
 
1132 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 
625 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  28.4 
 
 
254 aa  72  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  37.16 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  25.3 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.57 
 
 
781 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
668 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  25.9 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  26.57 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>