271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2495 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  51.8 
 
 
760 aa  706    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  100 
 
 
772 aa  1583    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  46.26 
 
 
663 aa  538  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  40.83 
 
 
539 aa  355  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  41.26 
 
 
329 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  34.71 
 
 
310 aa  149  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  35.45 
 
 
370 aa  134  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  35.24 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  34.94 
 
 
341 aa  127  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  32.4 
 
 
381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 
768 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  36.95 
 
 
276 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  33.22 
 
 
361 aa  111  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  33.68 
 
 
301 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  30.75 
 
 
289 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  38.12 
 
 
201 aa  107  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  25.29 
 
 
559 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  33.1 
 
 
330 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  32.79 
 
 
262 aa  103  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  31.95 
 
 
294 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  31.99 
 
 
327 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  33.45 
 
 
276 aa  101  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  29.8 
 
 
226 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  32.28 
 
 
224 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 
358 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.41 
 
 
226 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  33.62 
 
 
233 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  32.17 
 
 
245 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  31.42 
 
 
386 aa  95.5  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  32.91 
 
 
263 aa  95.5  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.08 
 
 
223 aa  95.1  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
715 aa  95.5  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 
489 aa  95.1  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  32.35 
 
 
282 aa  94  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  30.93 
 
 
225 aa  94  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  33.68 
 
 
225 aa  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
475 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  30.31 
 
 
230 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.05 
 
 
922 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  31.73 
 
 
366 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  33.16 
 
 
226 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.62 
 
 
446 aa  87.8  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  33.48 
 
 
587 aa  87.4  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 
270 aa  87.4  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  40.15 
 
 
614 aa  86.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  31.86 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  26.87 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  40.67 
 
 
323 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  32.11 
 
 
214 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.97 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  35.57 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  29.81 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.52 
 
 
952 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.81 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  25.28 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
617 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 
398 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  28.73 
 
 
296 aa  80.5  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  27.82 
 
 
1132 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  38.21 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  36.31 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.43 
 
 
829 aa  78.2  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  31.43 
 
 
603 aa  77.8  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  27.34 
 
 
929 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  40.94 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.04 
 
 
336 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 
267 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.38 
 
 
892 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  35.76 
 
 
742 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.38 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.74 
 
 
820 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  31.09 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 
668 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  25.75 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.24 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  29.52 
 
 
611 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
623 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.1 
 
 
636 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  34.69 
 
 
1581 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  23.47 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  34.23 
 
 
319 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
616 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  24.91 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 
293 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  41.59 
 
 
359 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  24.91 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  25.55 
 
 
269 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 
1186 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
925 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.17 
 
 
586 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>