267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4110 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
293 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  51.94 
 
 
287 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  52.92 
 
 
262 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  30.16 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  39.86 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  37.3 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  33.16 
 
 
214 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  32.97 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
226 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  30.21 
 
 
225 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  34.81 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  28.68 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  29.91 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  29.28 
 
 
361 aa  85.9  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  32.8 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  25.42 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  29.02 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  28.25 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  31.46 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  28.36 
 
 
446 aa  82  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  29 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  35.05 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  27.98 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  35.33 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 
475 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  26.86 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  25.94 
 
 
952 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  29.22 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  30.49 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  31.11 
 
 
772 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  30.8 
 
 
663 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  26.48 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  28.5 
 
 
660 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  26.44 
 
 
559 aa  69.7  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  32.79 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  30.73 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 
356 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  25.77 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.37 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  26.67 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 
511 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  40.7 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.2 
 
 
1911 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  29.09 
 
 
768 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  29.82 
 
 
570 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  24.68 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  31.07 
 
 
508 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.72 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 
554 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 
398 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  27.4 
 
 
398 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  30.5 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  25.57 
 
 
603 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  29.82 
 
 
520 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.48 
 
 
636 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  25.2 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
617 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  25.83 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  27.97 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  24.27 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  24.22 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  25.63 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  34.03 
 
 
464 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  26.89 
 
 
369 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  26.43 
 
 
1104 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  27.03 
 
 
527 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  27.06 
 
 
426 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.41 
 
 
587 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  28.39 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  42.27 
 
 
384 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
637 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  27.05 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  25.91 
 
 
614 aa  59.7  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  28.72 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.75 
 
 
862 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  26.16 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  32.93 
 
 
201 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  26.27 
 
 
395 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  27.84 
 
 
601 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.75 
 
 
1196 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.04 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  27.27 
 
 
262 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  30.99 
 
 
458 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  41.67 
 
 
454 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  27.18 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  26.46 
 
 
522 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.24 
 
 
892 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  26.82 
 
 
502 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  26.82 
 
 
515 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  25.45 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  33.79 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
625 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>