188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2877 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1041    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  93.23 
 
 		 515 aa  986    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  53.4 
 
 		 508 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  54.49 
 
 		 511 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  53.67 
 
 		 511 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  44.09 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  36.09 
 
 		 515 aa  264  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  34.76 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  34.97 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  37.24 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  35.81 
 
 		 545 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  34.78 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  29.8 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  29.62 
 
 		 570 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  29.8 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 569 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  29.68 
 
 		 569 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  29.63 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  29.93 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  29.17 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  28.31 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  27.85 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  28.66 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.23 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  27.88 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  28.66 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  26.29 
 
 		 654 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  25.88 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  27.72 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 		 223 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  26.2 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  28.12 
 
 		 233 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  30.32 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  27.54 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  25.86 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  27.27 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  26.82 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  27.74 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  29.21 
 
 		 338 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  27.13 
 
 		 230 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.65 
 
 		 277 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  26.29 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  32.03 
 
 		 334 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  28.85 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.05 
 
 		 820 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 		 377 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 715 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  31.5 
 
 		 294 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  25.21 
 
 		 611 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  28.57 
 
 		 327 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  34.38 
 
 		 370 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  25.68 
 
 		 279 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  30 
 
 		 491 aa  53.5  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  28.14 
 
 		 692 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  28.31 
 
 		 253 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.08 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  40.23 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  27.73 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.45 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  38.4 
 
 		 1053 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  25.89 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  29.3 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  28.22 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  31.58 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.46 
 
 		 922 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0172  hypothetical protein  26.52 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  28.82 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  27.55 
 
 		 254 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 		 1049 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  40.82 
 
 		 299 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  25.13 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  25.51 
 
 		 660 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 		 1007 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 		 475 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  32.03 
 
 		 775 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  24.78 
 
 		 331 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.76 
 
 		 293 aa  50.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 617 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.43 
 
 		 636 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  27.57 
 
 		 603 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  36 
 
 		 356 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  37.61 
 
 		 306 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  27.44 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  30.66 
 
 		 341 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  27.23 
 
 		 267 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>