226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0252 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
262 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  64.86 
 
 
287 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  52.92 
 
 
293 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  29.18 
 
 
370 aa  85.9  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  32.39 
 
 
366 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  82  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  32.38 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  30.74 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  29.96 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  29.81 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  28.21 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  29.3 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  30.98 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  31.77 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  28.49 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  30.11 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  30.22 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  29.83 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  30.11 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  31.3 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  29.61 
 
 
663 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  31.84 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  26.88 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  32.45 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  29.79 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  36.55 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  32.5 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  31.32 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  27.88 
 
 
772 aa  68.9  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  33.95 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  26.86 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  28.29 
 
 
660 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  29.61 
 
 
570 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  28.93 
 
 
511 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  31.03 
 
 
520 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 
925 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  36.6 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  28.3 
 
 
511 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  24.48 
 
 
336 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  28.37 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  33.54 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  28.73 
 
 
508 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  29.18 
 
 
570 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  35.04 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  24.91 
 
 
952 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  30.53 
 
 
538 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.29 
 
 
446 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  30.48 
 
 
1049 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 
489 aa  59.3  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  25.87 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  27.24 
 
 
539 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  25.4 
 
 
586 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  28.31 
 
 
760 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  25.99 
 
 
475 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  25.22 
 
 
361 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  32.19 
 
 
877 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  40.24 
 
 
614 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  40.91 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
569 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  24.47 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  30 
 
 
344 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 
538 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  28.74 
 
 
545 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  26.16 
 
 
559 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  29.2 
 
 
538 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  28.37 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  28.19 
 
 
768 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  26.47 
 
 
1196 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  29.11 
 
 
512 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  29.2 
 
 
538 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  31.54 
 
 
636 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.67 
 
 
416 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  33.66 
 
 
537 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.1 
 
 
491 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  27.38 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.45 
 
 
820 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.67 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  25.76 
 
 
346 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.77 
 
 
1183 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4493  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  26.67 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  27.6 
 
 
923 aa  52.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  26.36 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  28.22 
 
 
515 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  29.05 
 
 
657 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.97 
 
 
892 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  28.22 
 
 
502 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  25.41 
 
 
356 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
882 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 
554 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  32.39 
 
 
287 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  28.26 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  30.16 
 
 
965 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>