More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1561 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
361 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
308 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  30.34 
 
 
692 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  31.77 
 
 
475 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  31.55 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  36.57 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.1 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  28.43 
 
 
586 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  31.08 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  29.08 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  27.72 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  30.06 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 
668 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  29.06 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  35.38 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  28.87 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.94 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
715 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  39.26 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30.37 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  26.89 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  30.49 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  28.86 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  28.36 
 
 
240 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  25.07 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  30.23 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.29 
 
 
820 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.16 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  30.73 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.56 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  30.67 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 
925 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  31.13 
 
 
862 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.57 
 
 
616 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  31.21 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  23.2 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  36.27 
 
 
1911 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  25.73 
 
 
802 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.57 
 
 
527 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  36.52 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.12 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.4 
 
 
742 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 
1132 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  37.39 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  30.38 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  26.05 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  34.23 
 
 
965 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  25.77 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0172  hypothetical protein  30.6 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.88 
 
 
952 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.7 
 
 
226 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25.33 
 
 
587 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.37 
 
 
1104 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  27.64 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  31.58 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  31.58 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  31.03 
 
 
1196 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  25.65 
 
 
654 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  25.96 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.65 
 
 
929 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  25.64 
 
 
829 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 
289 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.14 
 
 
657 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  33.01 
 
 
664 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  30.6 
 
 
654 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  27.84 
 
 
233 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 
740 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  40 
 
 
614 aa  65.1  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.57 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  29.89 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  29.82 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  27.22 
 
 
535 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  28.09 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  33.03 
 
 
603 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  27.72 
 
 
230 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
698 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.75 
 
 
586 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.45 
 
 
510 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
623 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.7 
 
 
781 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.23 
 
 
922 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  23 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>