17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0254 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  40 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  46.97 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  46.76 
 
 		 401 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  33.12 
 
 		 521 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1772  WD repeat-containing protein  33.58 
 
 		 981 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  30.71 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  35.2 
 
 		 490 aa  75.5  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  31.86 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  24.87 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  28.68 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  28.68 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  32.99 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  26.67 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  35 
 
 		 541 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  27.48 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>