More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5254 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  76.39 
 
 		 245 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  56.76 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  56.76 
 
 		 226 aa  271  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  54.67 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  53.33 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  56.81 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  54.05 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  55.76 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  59.24 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  57.94 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  43.49 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  44.98 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.08 
 
 		 475 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  34.51 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  34.57 
 
 		 587 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.68 
 
 		 802 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  34.07 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 820 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  33.92 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  34.17 
 
 		 636 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  40.84 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.68 
 
 		 603 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  37.04 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 		 358 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  37.98 
 
 		 446 aa  118  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.18 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  32.65 
 
 		 611 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  34.18 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 346 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.58 
 
 		 416 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.94 
 
 		 929 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 882 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  31.92 
 
 		 781 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  37.02 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.07 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  43.79 
 
 		 359 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  37.67 
 
 		 768 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  32.34 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  32.11 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  34.65 
 
 		 489 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 617 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 621 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 625 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 637 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 620 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 593 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  34.85 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.28 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  30.04 
 
 		 892 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  30.3 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 623 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  41.03 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 618 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  35.06 
 
 		 663 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 715 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 		 538 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  30.55 
 
 		 877 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 398 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 616 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  38.2 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.29 
 
 		 751 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 637 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  31.97 
 
 		 740 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  34.09 
 
 		 539 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.62 
 
 		 267 aa  99  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.15 
 
 		 952 aa  98.6  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  29.33 
 
 		 1132 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  34.76 
 
 		 356 aa  98.2  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  28.96 
 
 		 522 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.64 
 
 		 922 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  33.62 
 
 		 772 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.97 
 
 		 298 aa  96.3  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  29.79 
 
 		 862 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  35.33 
 
 		 321 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.95 
 
 		 586 aa  95.1  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 336 aa  95.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 292 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 639 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 292 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.11 
 
 		 398 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 639 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 		 1104 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1911 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  31.75 
 
 		 527 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 426 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  34.76 
 
 		 370 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  33.18 
 
 		 330 aa  92.8  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  32.3 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.95 
 
 		 826 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 		 319 aa  92.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  27.99 
 
 		 620 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.98 
 
 		 925 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.09 
 
 		 742 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  30.88 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  31.3 
 
 		 361 aa  91.7  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  28.52 
 
 		 310 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>