More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1278 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  48.83 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  45.42 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  41.67 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  36.08 
 
 		 600 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  35.4 
 
 		 549 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.47 
 
 		 628 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.12 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  35.03 
 
 		 556 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  36.14 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  36.05 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  36.65 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  33.84 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  30.31 
 
 		 586 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.39 
 
 		 826 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.97 
 
 		 416 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 1104 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.25 
 
 		 820 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 		 433 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  33.2 
 
 		 657 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 625 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.38 
 
 		 929 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  33.2 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.42 
 
 		 751 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  33.2 
 
 		 654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  30.27 
 
 		 892 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  30.67 
 
 		 522 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 637 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  27.36 
 
 		 538 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.02 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  30.45 
 
 		 603 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.26 
 
 		 616 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.56 
 
 		 611 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1196 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.48 
 
 		 527 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 925 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 616 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  30.11 
 
 		 802 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  31.12 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1911 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 882 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  30.6 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.22 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.3 
 
 		 586 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  28.69 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 639 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 639 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  29.28 
 
 		 862 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  30.97 
 
 		 664 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.84 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.18 
 
 		 829 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.43 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 621 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  30.19 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  32.4 
 
 		 491 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  30.86 
 
 		 781 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.07 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.38 
 
 		 742 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.27 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.13 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  29.71 
 
 		 605 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 593 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 		 637 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  28.14 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 620 aa  99  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.52 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 		 654 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 617 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.89 
 
 		 636 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  30.65 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  30.98 
 
 		 390 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 		 359 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  27.55 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  31.6 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.65 
 
 		 570 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.51 
 
 		 740 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.52 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  30.43 
 
 		 620 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.44 
 
 		 587 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  33.06 
 
 		 535 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 		 453 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  31.13 
 
 		 263 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  31.6 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  31.9 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  29.62 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  30 
 
 		 877 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  29.08 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.25 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 618 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  26.13 
 
 		 624 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>