More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0887 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  500  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  40.17 
 
 
535 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  40.95 
 
 
570 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  43.41 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  42.31 
 
 
523 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  36.64 
 
 
413 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  40.49 
 
 
292 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  39.79 
 
 
586 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  40.21 
 
 
654 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  39.05 
 
 
616 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  39.69 
 
 
657 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  42.03 
 
 
491 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  138  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  47.89 
 
 
289 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  37.5 
 
 
605 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
698 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
611 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  36.5 
 
 
497 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  40.7 
 
 
751 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  39.77 
 
 
433 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  34.32 
 
 
398 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  35.12 
 
 
358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  34.36 
 
 
692 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.93 
 
 
398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
625 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  34.27 
 
 
892 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  36.6 
 
 
624 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.98 
 
 
636 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.16 
 
 
1911 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
637 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  38 
 
 
882 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.48 
 
 
826 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
617 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  34.83 
 
 
781 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.49 
 
 
862 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.32 
 
 
820 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  37.87 
 
 
829 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 
621 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  40.29 
 
 
925 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  34.33 
 
 
603 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  33.33 
 
 
929 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
620 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.88 
 
 
586 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
637 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.92 
 
 
475 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
509 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 
616 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 
517 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.08 
 
 
446 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  32.95 
 
 
338 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  41.1 
 
 
527 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.26 
 
 
740 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
593 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  36.47 
 
 
319 aa  99  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 
1132 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  36.84 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.63 
 
 
416 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  31.78 
 
 
620 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  35.59 
 
 
556 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  37.06 
 
 
348 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  37.8 
 
 
1186 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  35.09 
 
 
742 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.06 
 
 
348 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
1201 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.92 
 
 
346 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  32.16 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.68 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.79 
 
 
293 aa  95.5  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  29.76 
 
 
281 aa  95.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  32.84 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  40.29 
 
 
538 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  29.52 
 
 
282 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.63 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  33.85 
 
 
522 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  36.09 
 
 
600 aa  92.8  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  37.35 
 
 
664 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
618 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 
426 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  36.88 
 
 
293 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 
654 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  36.09 
 
 
549 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  30.8 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  39.46 
 
 
877 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  35.86 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.71 
 
 
325 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
1049 aa  89  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 
628 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  40.69 
 
 
555 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  28.24 
 
 
351 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  30.09 
 
 
292 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  32.31 
 
 
584 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
639 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  33.54 
 
 
1007 aa  88.6  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
639 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  31.1 
 
 
1196 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 
1053 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.71 
 
 
390 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  39.87 
 
 
384 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>