235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4380 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0261  NirV protein, putative  70.39 
 
 
306 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394932  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0237  putative NirV protein  71.53 
 
 
290 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6277  hypothetical protein  53.72 
 
 
304 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11907  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4272  hypothetical protein  50.6 
 
 
289 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4624  protein of unknown function DUF323  49.17 
 
 
293 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  44.71 
 
 
293 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1596  hypothetical protein  43.39 
 
 
284 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
657 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  29 
 
 
240 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  29.02 
 
 
654 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.12 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.96 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  29 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  30.18 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  28.16 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  23.83 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.19 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 
523 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  24.7 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  27.51 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  24.59 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  25.94 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  26.19 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  29.9 
 
 
605 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
751 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  26.24 
 
 
586 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.4 
 
 
517 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  25.83 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  25.53 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.54 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  26.07 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
611 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  32.71 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.89 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  27.66 
 
 
491 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  25.58 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  34.62 
 
 
624 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  25.77 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.34 
 
 
433 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  33.59 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  23.86 
 
 
628 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
698 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  29.35 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  26.57 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  25.39 
 
 
781 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  25.38 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  36.45 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.82 
 
 
654 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  24.85 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  28.5 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.5 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  30.28 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  24.7 
 
 
1160 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.27 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  32.12 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  22.14 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
1818 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 
358 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  36.97 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  25.57 
 
 
390 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
509 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 
925 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
882 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  27.12 
 
 
826 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  29.21 
 
 
742 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.21 
 
 
922 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  24 
 
 
446 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  24.41 
 
 
556 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  27.83 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.01 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  37.27 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  27.83 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  24.05 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  23.4 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  27.75 
 
 
475 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  31.41 
 
 
351 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  28.23 
 
 
1049 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  34.26 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  29.56 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  27.01 
 
 
325 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  27.17 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  25.84 
 
 
291 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  27.98 
 
 
309 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.79 
 
 
586 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  25.09 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.82 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1489  protein of unknown function DUF323  20.64 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000202441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 
618 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.13 
 
 
929 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  23.97 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>