278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1596 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4272  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0237  putative NirV protein  42.91 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0261  NirV protein, putative  42.91 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394932  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6277  hypothetical protein  44.17 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11907  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  41.03 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4624  protein of unknown function DUF323  46.78 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  42.28 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.9 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 		 657 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.46 
 
 		 654 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.73 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  29.13 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.82 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  34.7 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  32.08 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  28.84 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.04 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.35 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  29.36 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  26.4 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  29.75 
 
 		 781 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  32.6 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 		 570 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.32 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  28.46 
 
 		 852 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.59 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  24.79 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.41 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  30.29 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  30.85 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 		 611 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 		 523 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  26.74 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2148  hypothetical protein  29.14 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0453912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 861 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  28.99 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.51 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.32 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.13 
 
 		 603 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  25.81 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.98 
 
 		 751 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.55 
 
 		 535 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  27.27 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  28.57 
 
 		 929 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.65 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  32.68 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  27.32 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.89 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.28 
 
 		 1132 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  29.51 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 826 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  27.35 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  31.31 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  33.15 
 
 		 775 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  29.89 
 
 		 1186 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.11 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 698 aa  59.3  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  27.33 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 1104 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  27.59 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  30.99 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  24.44 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  25.45 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.04 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  25.09 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  26.63 
 
 		 925 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1196 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  27.22 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1818 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 554 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.91 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.91 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  30.82 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.41 
 
 		 781 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  24.89 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  26.24 
 
 		 584 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  26.59 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1911 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  27.12 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 617 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 892 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 623 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>