More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6827 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4624  protein of unknown function DUF323  59.58 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  44.71 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6277  hypothetical protein  44.14 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11907  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4272  hypothetical protein  45.9 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0237  putative NirV protein  44.86 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0261  NirV protein, putative  44.86 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1596  hypothetical protein  42.28 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.65 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  31.22 
 
 		 654 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.67 
 
 		 616 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.38 
 
 		 657 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.74 
 
 		 413 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.68 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 398 aa  85.9  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  30.16 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.74 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.69 
 
 		 570 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  35.39 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  29.58 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  29.08 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  29.69 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.1 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  28.09 
 
 		 586 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  34.57 
 
 		 535 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.89 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  32.43 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1196 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  43.14 
 
 		 605 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 		 775 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 698 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.88 
 
 		 829 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.06 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.76 
 
 		 826 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.96 
 
 		 751 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 		 611 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  28.41 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  39.81 
 
 		 624 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  39.25 
 
 		 925 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  38.1 
 
 		 892 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.18 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  27.59 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.33 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.33 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.63 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  27.46 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  41.53 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.98 
 
 		 636 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  33.54 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1911 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  37.19 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  40.8 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  27.76 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  40.91 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  27.76 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.52 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 637 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  29.14 
 
 		 929 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.68 
 
 		 1186 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.32 
 
 		 603 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 862 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 1053 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  28.98 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.91 
 
 		 586 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.2 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  38.39 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  32.56 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  27.4 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  40.78 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  41.51 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  26.97 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.68 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  39.05 
 
 		 923 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  30.57 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  39.02 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.64 
 
 		 952 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.38 
 
 		 820 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  34.48 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>