More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0572 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  786    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  76.25 
 
 
361 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  67.17 
 
 
381 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  66.57 
 
 
370 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  61.13 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  62.95 
 
 
341 aa  354  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  62.36 
 
 
330 aa  353  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  76.29 
 
 
201 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  38.7 
 
 
559 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  35 
 
 
366 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  33.5 
 
 
329 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  33.94 
 
 
663 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  29.43 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  30 
 
 
310 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  32.08 
 
 
539 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  33.33 
 
 
772 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  27.66 
 
 
214 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
715 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.43 
 
 
226 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  41.98 
 
 
263 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33 
 
 
586 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  31.82 
 
 
226 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  30.13 
 
 
225 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  34.08 
 
 
230 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  32.27 
 
 
226 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  39.52 
 
 
1581 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  31.16 
 
 
760 aa  99.8  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.78 
 
 
826 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.96 
 
 
768 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.55 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  32.57 
 
 
245 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  38.75 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  38.61 
 
 
282 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  29.25 
 
 
325 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 
319 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.18 
 
 
829 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  28.99 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  35.19 
 
 
270 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  35.88 
 
 
287 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  41.18 
 
 
742 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  33.12 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  33.18 
 
 
336 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  32.49 
 
 
276 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.24 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  33.18 
 
 
233 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  26.33 
 
 
922 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.97 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 
287 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 
267 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
223 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.84 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  28.31 
 
 
293 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.71 
 
 
751 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  30.09 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  30.8 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  33.96 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.75 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.34 
 
 
1911 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  29 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  30.51 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  38.36 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  29.33 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  26.38 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.62 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  33.18 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.75 
 
 
1104 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  36.2 
 
 
1186 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  32.02 
 
 
952 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.09 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  26.57 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.59 
 
 
740 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  26.71 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  31.16 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  36.31 
 
 
1196 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.66 
 
 
554 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  36.2 
 
 
892 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
882 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  33.33 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  35.47 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.68 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.34 
 
 
1200 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.42 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.69 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  35.66 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  31.72 
 
 
636 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  31.61 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  32.34 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>