More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1267 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
270 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  62.59 
 
 
230 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  42.22 
 
 
226 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  41.48 
 
 
214 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  41.85 
 
 
225 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  40.74 
 
 
226 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  41.11 
 
 
225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  44.44 
 
 
245 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  43.49 
 
 
233 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  55.83 
 
 
226 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  44.61 
 
 
223 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  44.07 
 
 
224 aa  204  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  49.71 
 
 
237 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  36.55 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.17 
 
 
263 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  34.47 
 
 
276 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
1132 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.64 
 
 
826 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  36.1 
 
 
301 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  33.65 
 
 
289 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
279 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  34.63 
 
 
356 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.98 
 
 
293 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  36.46 
 
 
922 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  35.52 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  32.23 
 
 
310 aa  99.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  36.22 
 
 
587 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  35.37 
 
 
359 aa  99  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.52 
 
 
475 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  32.5 
 
 
489 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  35.6 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 
829 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 
433 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.53 
 
 
586 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  41.57 
 
 
768 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  36.36 
 
 
446 aa  95.9  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  40.62 
 
 
296 aa  95.5  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
715 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  36.81 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.9 
 
 
802 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  33.16 
 
 
336 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  38.26 
 
 
336 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.56 
 
 
267 aa  92  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  32.97 
 
 
358 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.74 
 
 
325 aa  92  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  36.42 
 
 
401 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  33.16 
 
 
760 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.23 
 
 
820 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  30.85 
 
 
366 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  34.07 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  37.79 
 
 
1049 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  32.31 
 
 
611 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  33.87 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 
398 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  31.58 
 
 
341 aa  89.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  40.74 
 
 
327 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  31.28 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.04 
 
 
751 aa  89.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  34.39 
 
 
772 aa  89  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
637 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  35.45 
 
 
742 aa  88.6  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  36.05 
 
 
862 aa  88.6  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  36.05 
 
 
892 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  36.02 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.55 
 
 
416 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 
517 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  40.83 
 
 
323 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.5 
 
 
636 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
1104 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.05 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  35.53 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  30.08 
 
 
1064 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  32.24 
 
 
381 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  37.07 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  30.77 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  30.48 
 
 
370 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.42 
 
 
1911 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.81 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  31.09 
 
 
663 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  32.45 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 
625 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.9 
 
 
952 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  32.5 
 
 
740 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.85 
 
 
896 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.08 
 
 
781 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 
925 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
882 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  31.07 
 
 
654 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  31.98 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  34.24 
 
 
298 aa  82  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
346 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
1007 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  35.23 
 
 
603 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.99 
 
 
929 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.12 
 
 
1200 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>