214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4058 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1066    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  52.4 
 
 
537 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  33.53 
 
 
520 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 
511 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  35.64 
 
 
508 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  32.56 
 
 
511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  36.99 
 
 
515 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  35.82 
 
 
502 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  35.03 
 
 
515 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  34.07 
 
 
512 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  35.25 
 
 
570 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  34.3 
 
 
570 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  31.83 
 
 
601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  29.15 
 
 
569 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  38.57 
 
 
538 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  38.33 
 
 
538 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  36.93 
 
 
538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  30.67 
 
 
569 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  28.44 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  31.82 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
925 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.26 
 
 
636 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.44 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.02 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  26.67 
 
 
877 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.11 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 
398 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  31.28 
 
 
230 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.26 
 
 
446 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 
263 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  28.51 
 
 
269 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  31.75 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  26.1 
 
 
334 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.77 
 
 
603 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  28.36 
 
 
224 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.18 
 
 
781 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.46 
 
 
298 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 
359 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  24.9 
 
 
289 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  38.98 
 
 
370 aa  63.9  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  28.99 
 
 
346 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  25.97 
 
 
267 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.85 
 
 
1911 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  29.61 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.46 
 
 
952 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.97 
 
 
276 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  26.45 
 
 
527 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  24.9 
 
 
584 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.18 
 
 
768 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
882 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  28.07 
 
 
538 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.73 
 
 
523 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  36.21 
 
 
341 aa  60.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 
323 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  29.95 
 
 
488 aa  60.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  27.66 
 
 
327 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
625 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.24 
 
 
820 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.7 
 
 
587 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 
740 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  33.12 
 
 
299 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  26.26 
 
 
929 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.78 
 
 
668 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  27.94 
 
 
233 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.03 
 
 
922 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  29.29 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
621 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.05 
 
 
892 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 
287 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.75 
 
 
426 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.01 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  36.97 
 
 
386 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  32.41 
 
 
201 aa  58.9  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  23.08 
 
 
226 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 
617 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
593 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 
517 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  22.45 
 
 
226 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.1 
 
 
654 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 
401 aa  57.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.5 
 
 
291 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  26.48 
 
 
664 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  33.03 
 
 
361 aa  57  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  26.12 
 
 
1104 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 
570 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  31.16 
 
 
245 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.14 
 
 
338 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30.5 
 
 
616 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  28.74 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 
618 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  26.56 
 
 
862 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  26.38 
 
 
301 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 
223 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  25.81 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29 
 
 
616 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>