216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3420 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3133  hypothetical protein  94.61 
 
 
538 aa  945    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3870  hypothetical protein  95.17 
 
 
538 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0563781  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3420  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1078    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4233  hypothetical protein  33.6 
 
 
511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0277487  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0464  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 
511 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2626  hypothetical protein  32.94 
 
 
515 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00927742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2877  hypothetical protein  34.97 
 
 
502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.112467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52010  hypothetical protein  33.4 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2146  hypothetical protein  37.56 
 
 
520 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3148  hypothetical protein  38.65 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.358064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3222  protein of unknown function DUF323  36.02 
 
 
512 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33154  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4058  hypothetical protein  29.76 
 
 
545 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0903  hypothetical protein  36.65 
 
 
537 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0493505  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1319  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
569 aa  153  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2310  hypothetical protein  26.66 
 
 
601 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0333269  hitchhiker  0.0000166266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00830  hypothetical protein  33.04 
 
 
570 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.313618  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1667  hypothetical protein  32.17 
 
 
569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  28.35 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  31.33 
 
 
262 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  27.8 
 
 
603 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 
276 aa  63.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.32 
 
 
692 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
617 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  34.22 
 
 
223 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  28.37 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 
475 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  29.83 
 
 
586 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.4 
 
 
820 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  27.11 
 
 
929 aa  60.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  28 
 
 
279 aa  60.1  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.43 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  23.79 
 
 
740 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 
262 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  25.56 
 
 
289 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  28.86 
 
 
802 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  28.71 
 
 
922 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 
321 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  29.63 
 
 
654 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.08 
 
 
636 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.1 
 
 
781 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  23.5 
 
 
358 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  30.15 
 
 
287 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  41.56 
 
 
267 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  41.46 
 
 
323 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
623 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
625 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  27.18 
 
 
301 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
637 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.68 
 
 
616 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.13 
 
 
336 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  28.5 
 
 
292 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.85 
 
 
346 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  31.51 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  43.33 
 
 
291 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  30.22 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 
555 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  38.28 
 
 
306 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
509 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  27.5 
 
 
862 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
554 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  36.07 
 
 
366 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  31.79 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  38.46 
 
 
334 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  29.11 
 
 
263 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  43.37 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  43.37 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  43.02 
 
 
295 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 
401 aa  54.3  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  32.47 
 
 
293 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  28.95 
 
 
587 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  37.8 
 
 
359 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 
657 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
637 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  39.6 
 
 
375 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  26.09 
 
 
1911 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  26.92 
 
 
768 aa  53.5  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  29.05 
 
 
952 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
1104 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  37.38 
 
 
312 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  30.72 
 
 
245 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  25.29 
 
 
226 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.61 
 
 
654 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  24.57 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
621 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  26.29 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  28.5 
 
 
491 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  31.16 
 
 
341 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
620 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4110  protein of unknown function DUF323  29.47 
 
 
293 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
593 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
882 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  41.03 
 
 
336 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  39.25 
 
 
299 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  31.91 
 
 
226 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>