272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5515 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5515  gliding motility-associated lipoprotein GldJ  100 
 
 
420 aa  871    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3694  protein of unknown function DUF323  66.67 
 
 
420 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.347987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3494  gliding motility-related protein; serine kinase  60.29 
 
 
396 aa  528  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  48.07 
 
 
395 aa  376  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1181  protein of unknown function DUF323  40.04 
 
 
510 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05475  lipoprotein, putative  40.69 
 
 
566 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0756  protein involved in gliding motility GldJ  41.3 
 
 
548 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00917249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1557  hypothetical protein  42.64 
 
 
563 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.084665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  35.44 
 
 
344 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 
356 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  35.01 
 
 
377 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4062  protein of unknown function DUF323  43.03 
 
 
532 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  29.08 
 
 
369 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0483  protein of unknown function DUF323  35.02 
 
 
427 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000150306  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  33.9 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  32.42 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0383  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  33.79 
 
 
464 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0809  protein involved in gliding motility GldK  35 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  24.94 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  25.81 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  24.02 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  23.92 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  27.2 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  24.59 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  24.06 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  23.32 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  25.84 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  22.29 
 
 
1911 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  26.17 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  23.96 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  36.75 
 
 
301 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.28 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  25.56 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  24.8 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  24.52 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  23.51 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  24.52 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.45 
 
 
1104 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  23.51 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  24.1 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  23.73 
 
 
742 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  32.8 
 
 
310 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  23.33 
 
 
312 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  30.54 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  24.48 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  29.79 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  29.53 
 
 
740 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  23.68 
 
 
277 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  30.89 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  25.34 
 
 
322 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  23.66 
 
 
527 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  29.73 
 
 
299 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  31.55 
 
 
301 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
308 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  31.67 
 
 
295 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.05 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  24.93 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  23.25 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  34.39 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  32.8 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.92 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  23.48 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  22.22 
 
 
826 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  31.91 
 
 
290 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  24.93 
 
 
337 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  22.97 
 
 
330 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  31.67 
 
 
291 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  22.07 
 
 
517 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  26.82 
 
 
668 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  30.6 
 
 
291 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  29.12 
 
 
1132 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  30.6 
 
 
291 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  27.93 
 
 
952 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  27.62 
 
 
348 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  24.31 
 
 
337 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  23.37 
 
 
291 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  27.62 
 
 
348 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.17 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  30.05 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  23.36 
 
 
751 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  22.07 
 
 
586 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  22.25 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
861 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  29.02 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
621 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  22.86 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  27.42 
 
 
603 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  30.85 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.91 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  22.1 
 
 
829 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  28.18 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  23.88 
 
 
311 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  28.96 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  29.83 
 
 
497 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>