More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2985 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  74.38 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  76.16 
 
 		 307 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  70.79 
 
 		 325 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  74.05 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  71.38 
 
 		 334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  70.96 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  64.87 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  67 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  68.32 
 
 		 324 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  64.24 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  64.69 
 
 		 322 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  64.9 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  63.75 
 
 		 315 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  64.69 
 
 		 310 aa  401  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  63.58 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  62.34 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  59.18 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  59.74 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  55.52 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  58.28 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  56.35 
 
 		 295 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  55.78 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  54.97 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  50.76 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  54.64 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  53.64 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  53.31 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  53.64 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  55.78 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  55.78 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  59 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  53.16 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  50.47 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  52.72 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  52.98 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  47.83 
 
 		 408 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  53.64 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  47.62 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  47.17 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  48.23 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  51.78 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  48.58 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  48.58 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  47.11 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  49.02 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  46.86 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  46.89 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 349 aa  282  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.27 
 
 		 375 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  49.18 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  50 
 
 		 291 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  48.09 
 
 		 341 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.82 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  45.71 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  44.81 
 
 		 301 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  44.37 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  43.52 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  39.94 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.94 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.06 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.13 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  39.48 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  39.48 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  39.81 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  39.48 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  39.48 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  40.28 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  40.41 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  37.63 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.53 
 
 		 510 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.45 
 
 		 751 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.86 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.09 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  32.23 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32.52 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.37 
 
 		 742 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.48 
 
 		 829 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  29.88 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  30.03 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.58 
 
 		 826 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.03 
 
 		 517 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.65 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1911 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.37 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.54 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  30.67 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.93 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.83 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.25 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.45 
 
 		 628 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>