233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0142 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 456 aa  921    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  34.18 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  32.68 
 
 		 265 aa  100  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 		 265 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  26.39 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  29.44 
 
 		 270 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.47 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  32.2 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  26.6 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  26.96 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  29.15 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.27 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.89 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  30.46 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  30.73 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  33.88 
 
 		 852 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 		 842 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 1818 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 861 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  32.24 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  26.67 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  31.6 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.34 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  40.54 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.95 
 
 		 766 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.8 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  31.13 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.69 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.29 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.57 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  37.7 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 1049 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.02 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  30.34 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1581 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.16 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  31.43 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.64 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.71 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  32.22 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1492 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.02 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  36.44 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.59 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  29.17 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  29.84 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  36.52 
 
 		 1007 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  28.82 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  29.02 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  27.47 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  36.75 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  24.89 
 
 		 751 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  32.47 
 
 		 1053 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  36.75 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  37 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  36.79 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5411  protein of unknown function DUF323  25.81 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  27.47 
 
 		 549 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  37.14 
 
 		 960 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  34.48 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  34.58 
 
 		 965 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 621 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  29.21 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  28.49 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  38.24 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  26.94 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.12 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  35.58 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  36.89 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  34.17 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.1 
 
 		 1023 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  32.08 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1911 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  32.08 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  32.08 
 
 		 327 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  25.57 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  36.75 
 
 		 316 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  29.67 
 
 		 1160 aa  54.3  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  33.91 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04714  lipoprotein, putative  27.78 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  34.21 
 
 		 307 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>