34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0116 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  49.09 
 
 
497 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  31.51 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  27.57 
 
 
684 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  36.67 
 
 
600 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  37.8 
 
 
219 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  37.88 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  43.84 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.94 
 
 
1085 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  46.43 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  40.35 
 
 
412 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  32.1 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  43.55 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  32.89 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  36.92 
 
 
436 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  35.37 
 
 
561 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  50 
 
 
546 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  31.4 
 
 
1096 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  40.38 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  35 
 
 
727 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  38.98 
 
 
374 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  36.67 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  24.87 
 
 
773 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  37.5 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  38.03 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
750 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  35.82 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  34.62 
 
 
930 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  34.55 
 
 
465 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  27.27 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  32.8 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4001  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000612736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6069  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
883 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249912  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  27.46 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>