72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0105 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
426 aa  833    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  57.25 
 
 
416 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  59.48 
 
 
409 aa  348  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  49.38 
 
 
412 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  39.34 
 
 
341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  56.79 
 
 
311 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  52.81 
 
 
287 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  47.64 
 
 
426 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  47.02 
 
 
196 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  28.48 
 
 
684 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  29.14 
 
 
456 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  28.83 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0106  hypothetical protein  64.58 
 
 
121 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.391238  normal  0.216792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  39.55 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  37.74 
 
 
435 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  32 
 
 
613 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  38.03 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  34.46 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  36.91 
 
 
1096 aa  83.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  32.78 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  32.95 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  35.81 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  30.41 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  32.61 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
752 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  30.3 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0113  hypothetical protein  48.75 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  27.51 
 
 
727 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  39.05 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  28.83 
 
 
1189 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  30.34 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
750 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  32.34 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  30.77 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.76 
 
 
1085 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
769 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  43.84 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  25.68 
 
 
963 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  27.81 
 
 
660 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
806 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  28.37 
 
 
311 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  29.53 
 
 
930 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  22.97 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1532  PEGA domain-containing protein  26.5 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0531517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  30.88 
 
 
266 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  30.77 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  31.4 
 
 
274 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6069  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
883 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249912  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  31.11 
 
 
843 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2297  PEGA domain-containing protein  38.36 
 
 
524 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0992  serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
774 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  29.23 
 
 
269 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  32.47 
 
 
247 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3858  protein kinase  34.91 
 
 
591 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.634646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  40.62 
 
 
338 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  34.94 
 
 
276 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  28.91 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  38.98 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.95 
 
 
841 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  32.84 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  35.21 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  34.44 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  25.56 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 
652 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2741  PEGA domain protein  30.09 
 
 
597 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3560  PEGA domain protein  29.27 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00097994  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 
334 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 
843 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2370  putative exported protease/peptidase  22.88 
 
 
208 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0426298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  28.4 
 
 
296 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  33.87 
 
 
118 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>