30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1197 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  30.46 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  28.83 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  44.74 
 
 
727 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  38 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  29.93 
 
 
909 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  31.01 
 
 
941 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  28.71 
 
 
892 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  46.43 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  38.1 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.43 
 
 
930 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.55 
 
 
1085 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  24.64 
 
 
847 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  33.77 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  32.5 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  26.76 
 
 
773 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  24.55 
 
 
963 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  38.67 
 
 
561 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  26.37 
 
 
600 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  29.82 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  23.7 
 
 
862 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
750 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  36.94 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  39.34 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  37.31 
 
 
613 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  32.39 
 
 
118 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  40 
 
 
456 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  40 
 
 
456 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  37.5 
 
 
684 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
307 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>