19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0035 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1008    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  46.03 
 
 		 323 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  47.89 
 
 		 225 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1967  hypothetical protein  41.55 
 
 		 208 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  46.67 
 
 		 432 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0392  hypothetical protein  32.62 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000941975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.19 
 
 		 802 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  45.24 
 
 		 823 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1438  hypothetical protein  54.88 
 
 		 184 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00281988  hitchhiker  0.000303146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.01 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  29.09 
 
 		 546 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  43.16 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  27.95 
 
 		 600 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  41.57 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1345  hypothetical protein  31.36 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.235761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  26.48 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  27.49 
 
 		 271 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  25.64 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  32.1 
 
 		 416 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>