19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2179 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  624  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0035  hypothetical protein  48.7 
 
 
520 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  54.23 
 
 
225 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1967  hypothetical protein  40.72 
 
 
208 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  48.2 
 
 
432 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0392  hypothetical protein  34.33 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000941975  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  54.22 
 
 
802 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  40.8 
 
 
497 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  51.9 
 
 
823 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.24 
 
 
719 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  39.41 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1438  hypothetical protein  49.46 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00281988  hitchhiker  0.000303146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  25.6 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1345  hypothetical protein  29.59 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.235761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  28.69 
 
 
546 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  26.83 
 
 
600 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  27.94 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  34.78 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  28.43 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>