More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0865 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1769  cobaltochelatase  45.9 
 
 
1801 aa  807    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.045286  normal  0.0158644 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  46.01 
 
 
1800 aa  813    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  100 
 
 
2065 aa  4259    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  32.58 
 
 
2110 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2144  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  42.32 
 
 
1504 aa  505  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11688  normal  0.0488981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3731  cobaltochelatase subunit CobN  42.41 
 
 
1538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563162  normal  0.493716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0797  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.78 
 
 
1442 aa  466  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1517  cobaltochelatase subunit CobN  32.53 
 
 
1758 aa  467  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.254627  hitchhiker  0.000129618 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0040  cobaltochelatase  45.16 
 
 
1579 aa  452  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0103552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40 
 
 
2113 aa  450  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  38.11 
 
 
1812 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2260  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  38.31 
 
 
1750 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0356952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0395  cobaltochelatase  37.91 
 
 
1727 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  40.56 
 
 
1551 aa  404  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0820  cobaltochelatase  38.22 
 
 
1738 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  39.41 
 
 
2168 aa  396  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1232  cobaltochelatase  39.92 
 
 
1340 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3671  Cobaltochelatase  34.49 
 
 
1366 aa  366  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2340  cobaltochelatase  37.01 
 
 
1318 aa  347  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0774  cobaltochelatase  34.17 
 
 
1323 aa  345  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1553  CobN/magnesium chelatase family protein  32.77 
 
 
1469 aa  300  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39640  cobaltochelatase subunit CobN  34.55 
 
 
1281 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3363  cobaltochelatase subunit CobN  34.32 
 
 
1281 aa  292  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2685  Cobaltochelatase  34.15 
 
 
1336 aa  290  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165295  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0753  Cobaltochelatase  34.08 
 
 
1413 aa  288  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2652  cobaltochelatase subunit CobN  33.41 
 
 
1300 aa  284  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0792  Cobaltochelatase  29.64 
 
 
1515 aa  247  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27480  CobN/magnesium chelatase family protein  30.05 
 
 
1457 aa  244  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.231054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  29.35 
 
 
1426 aa  240  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  32.95 
 
 
1244 aa  232  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  33.26 
 
 
1244 aa  229  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  29.05 
 
 
1266 aa  227  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  34.12 
 
 
1237 aa  226  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  29.91 
 
 
1220 aa  225  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0118  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.46 
 
 
1441 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  31.47 
 
 
1302 aa  224  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  32.17 
 
 
1298 aa  224  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  31.17 
 
 
1192 aa  223  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  29.78 
 
 
1256 aa  222  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  30.23 
 
 
1258 aa  222  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  31.19 
 
 
1280 aa  221  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  26.15 
 
 
1285 aa  221  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  30.59 
 
 
1222 aa  220  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  29.86 
 
 
1293 aa  219  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  31.01 
 
 
1277 aa  219  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  30.77 
 
 
1222 aa  219  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  29.18 
 
 
1304 aa  219  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  29.33 
 
 
1255 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.18 
 
 
1187 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.22 
 
 
1187 aa  216  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  30.88 
 
 
1264 aa  216  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  30.39 
 
 
1435 aa  216  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  29.49 
 
 
1379 aa  213  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  30.36 
 
 
1406 aa  213  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  31.36 
 
 
1207 aa  212  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.37 
 
 
1343 aa  211  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.22 
 
 
1453 aa  211  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  29.47 
 
 
1409 aa  210  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.46 
 
 
1152 aa  209  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  29.57 
 
 
1259 aa  210  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  29.09 
 
 
1238 aa  209  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  28.6 
 
 
1266 aa  209  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  30.39 
 
 
1247 aa  209  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  31.29 
 
 
1277 aa  209  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  30.65 
 
 
1269 aa  209  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  32.43 
 
 
1199 aa  209  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  32.66 
 
 
1210 aa  209  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  29.85 
 
 
1290 aa  208  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  31.82 
 
 
1444 aa  208  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  28.35 
 
 
1209 aa  208  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  28.97 
 
 
1203 aa  208  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  31.67 
 
 
1333 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  31.38 
 
 
1261 aa  206  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  31.37 
 
 
1190 aa  206  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  30.59 
 
 
1220 aa  206  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  31.9 
 
 
1330 aa  205  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  29.41 
 
 
1206 aa  205  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  30.28 
 
 
1207 aa  205  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  31.9 
 
 
1330 aa  205  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  28.73 
 
 
1288 aa  205  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  27.99 
 
 
1273 aa  204  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  30.37 
 
 
1220 aa  204  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  30.37 
 
 
1220 aa  204  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  30.37 
 
 
1220 aa  204  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  30.37 
 
 
1281 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  28.05 
 
 
1329 aa  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  30.89 
 
 
1196 aa  203  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  30.68 
 
 
1278 aa  203  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 
1281 aa  203  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  29.89 
 
 
1291 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 
1267 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  30.48 
 
 
1281 aa  202  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  28.32 
 
 
1261 aa  202  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  29.62 
 
 
1277 aa  202  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  30 
 
 
1191 aa  202  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  29.85 
 
 
1193 aa  202  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  30.14 
 
 
1348 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  31.75 
 
 
1194 aa  201  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  28.21 
 
 
1343 aa  201  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  30.61 
 
 
1364 aa  201  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>