26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03428 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  84.11 
 
 		 579 aa  1040    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  65.45 
 
 		 575 aa  786    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  68.84 
 
 		 574 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1216    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  48.41 
 
 		 559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  40.95 
 
 		 613 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  43.22 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  39.18 
 
 		 1452 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  32.87 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.69 
 
 		 739 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  27.87 
 
 		 875 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 1601 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  21.99 
 
 		 1076 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  22.63 
 
 		 833 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.71 
 
 		 665 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  25.86 
 
 		 815 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  21.93 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.14 
 
 		 998 aa  47.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  21.44 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  26.32 
 
 		 906 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  28.92 
 
 		 851 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  25.75 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  27.85 
 
 		 686 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  20.82 
 
 		 570 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  28 
 
 		 837 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>