20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002581 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  100 
 
 
579 aa  1214    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  69.72 
 
 
574 aa  837    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  84.11 
 
 
579 aa  1053    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  67.14 
 
 
575 aa  809    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  48.06 
 
 
559 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  40.99 
 
 
613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  41.39 
 
 
613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  43.9 
 
 
609 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  38.66 
 
 
1452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  33.56 
 
 
606 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  26.88 
 
 
875 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  27.85 
 
 
815 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.93 
 
 
998 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.05 
 
 
739 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  29.75 
 
 
686 aa  50.8  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.76 
 
 
1076 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  29.31 
 
 
1100 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.2 
 
 
665 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 
1601 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.52 
 
 
851 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>