56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0778 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  100 
 
 		 739 aa  1522    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  49.09 
 
 		 665 aa  611  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  40.94 
 
 		 803 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 		 632 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.18 
 
 		 591 aa  190  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.84 
 
 		 582 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  30.02 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 1601 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  29.26 
 
 		 578 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  28.66 
 
 		 885 aa  154  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  28.55 
 
 		 571 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 895 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  27.1 
 
 		 854 aa  138  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  31.99 
 
 		 833 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 606 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  30.11 
 
 		 775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 812 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 1224 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  28.08 
 
 		 875 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  27.69 
 
 		 874 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.98 
 
 		 867 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.58 
 
 		 900 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  27.79 
 
 		 1076 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.86 
 
 		 998 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  25.8 
 
 		 1100 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  26.4 
 
 		 537 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.35 
 
 		 927 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 649 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  26.48 
 
 		 815 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  25.47 
 
 		 1105 aa  95.5  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  26.74 
 
 		 864 aa  94  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  25.54 
 
 		 646 aa  92.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.06 
 
 		 621 aa  90.9  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  28.51 
 
 		 906 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  30 
 
 		 851 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.39 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.02 
 
 		 786 aa  75.1  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  36.26 
 
 		 1024 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.78 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  26.69 
 
 		 579 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  27.7 
 
 		 613 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  36.99 
 
 		 927 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  26.05 
 
 		 579 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  27.27 
 
 		 559 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  23.45 
 
 		 837 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2124  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 905 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545663  normal  0.891513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  29.83 
 
 		 574 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  24.9 
 
 		 1452 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  29.87 
 
 		 461 aa  48.5  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.11 
 
 		 815 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  23.96 
 
 		 609 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  24.88 
 
 		 570 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  39.19 
 
 		 654 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  31.11 
 
 		 673 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2677  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 855 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  27.78 
 
 		 617 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>