298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2044 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  79.85 
 
 		 1002 aa  969    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  97.5 
 
 		 1585 aa  1421    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  97 
 
 		 1217 aa  1419    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  80.7 
 
 		 1247 aa  1201    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  100 
 
 		 1474 aa  2952    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  47.25 
 
 		 650 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  48.36 
 
 		 1275 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  35.39 
 
 		 797 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  37.88 
 
 		 1223 aa  331  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  51.16 
 
 		 1295 aa  313  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  44.42 
 
 		 1748 aa  300  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  42.28 
 
 		 1160 aa  276  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  47.61 
 
 		 1266 aa  271  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  43.13 
 
 		 3793 aa  195  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  43.66 
 
 		 1288 aa  191  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  45.87 
 
 		 1108 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.12 
 
 		 1657 aa  184  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  45.43 
 
 		 991 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  49.37 
 
 		 1414 aa  162  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.25 
 
 		 746 aa  154  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 504 aa  148  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 512 aa  146  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1329 aa  138  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 572 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 1195 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 532 aa  134  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.76 
 
 		 523 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 547 aa  129  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.99 
 
 		 532 aa  127  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.77 
 
 		 538 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.33 
 
 		 2713 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 		 536 aa  123  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.63 
 
 		 559 aa  123  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  33.4 
 
 		 2270 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  37.72 
 
 		 1418 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.23 
 
 		 815 aa  121  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  31.53 
 
 		 1152 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 636 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 		 484 aa  118  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.51 
 
 		 546 aa  117  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.26 
 
 		 545 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.04 
 
 		 562 aa  115  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.54 
 
 		 511 aa  115  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 563 aa  113  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.7 
 
 		 551 aa  112  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.87 
 
 		 537 aa  110  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  23.96 
 
 		 550 aa  109  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.12 
 
 		 512 aa  109  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.31 
 
 		 535 aa  108  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.72 
 
 		 515 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.31 
 
 		 560 aa  107  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 		 519 aa  107  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 		 517 aa  107  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  32.26 
 
 		 522 aa  106  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.17 
 
 		 537 aa  106  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.65 
 
 		 537 aa  106  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.37 
 
 		 540 aa  105  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 		 522 aa  105  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 522 aa  104  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.33 
 
 		 566 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  25.63 
 
 		 527 aa  102  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 516 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  25.31 
 
 		 541 aa  102  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.72 
 
 		 1068 aa  101  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.82 
 
 		 1607 aa  100  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 540 aa  99  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.42 
 
 		 541 aa  99  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 518 aa  98.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 530 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 581 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.95 
 
 		 558 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 547 aa  96.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.22 
 
 		 577 aa  96.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.44 
 
 		 556 aa  96.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.76 
 
 		 539 aa  96.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 451 aa  96.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 521 aa  95.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  28 
 
 		 525 aa  95.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1547 aa  95.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  25.75 
 
 		 539 aa  94.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  29.91 
 
 		 552 aa  93.2  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.64 
 
 		 536 aa  92.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.35 
 
 		 546 aa  92.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  27.34 
 
 		 497 aa  92.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.3 
 
 		 989 aa  92  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 		 518 aa  91.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 492 aa  91.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  29.05 
 
 		 496 aa  91.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.2 
 
 		 1338 aa  91.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 537 aa  91.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 		 1020 aa  90.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  35.48 
 
 		 1050 aa  89.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 534 aa  89  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 514 aa  88.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  31.02 
 
 		 215 aa  88.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.36 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  27.1 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  50.98 
 
 		 1601 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  32.49 
 
 		 626 aa  84  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>