26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2050 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  907    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  33.02 
 
 
460 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  30.34 
 
 
841 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  28.35 
 
 
740 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  32.14 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  27.57 
 
 
1134 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  33.13 
 
 
1061 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  32.97 
 
 
797 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  25.94 
 
 
1140 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  23.33 
 
 
726 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  25.55 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  39.73 
 
 
915 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  25.95 
 
 
692 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  26.18 
 
 
704 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  25.4 
 
 
687 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  23.35 
 
 
695 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  22.59 
 
 
1346 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  29.45 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.19 
 
 
831 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  27.21 
 
 
888 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  31.88 
 
 
716 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.75 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.66 
 
 
522 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  25.62 
 
 
2554 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.37 
 
 
2286 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  30.6 
 
 
439 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>