137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4181 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1750 aa  3513    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  42.98 
 
 		 990 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  41.67 
 
 		 853 aa  184  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  38.46 
 
 		 743 aa  181  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  37.85 
 
 		 792 aa  175  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  34.67 
 
 		 831 aa  153  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2713 aa  142  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 		 3793 aa  130  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1220 aa  126  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.04 
 
 		 1345 aa  122  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  27.18 
 
 		 1108 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1329 aa  111  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.8 
 
 		 1657 aa  106  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  32.64 
 
 		 3602 aa  101  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  27.38 
 
 		 1083 aa  95.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1147 aa  92.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1117 aa  92.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.39 
 
 		 1288 aa  92.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1021 aa  92.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.87 
 
 		 1041 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1060 aa  90.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1054 aa  89.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1063 aa  87.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1043 aa  86.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1048 aa  85.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 999 aa  83.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1082 aa  82.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 931 aa  81.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1060 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.5 
 
 		 1607 aa  80.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1075 aa  78.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  27.31 
 
 		 925 aa  76.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1078 aa  76.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1969 aa  75.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1100 aa  74.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 1044 aa  73.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1090 aa  72  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  24.67 
 
 		 1084 aa  69.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.94 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  39.13 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  27.32 
 
 		 904 aa  67.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30.5 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.56 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  24.39 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.5 
 
 		 822 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1386 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.34 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.72 
 
 		 3191 aa  62.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 608 aa  62  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  27.7 
 
 		 953 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  32.6 
 
 		 691 aa  61.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  36.05 
 
 		 774 aa  61.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.71 
 
 		 1507 aa  61.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.99 
 
 		 1293 aa  61.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.1 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  33.82 
 
 		 815 aa  60.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  25.33 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.23 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.12 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  33.02 
 
 		 826 aa  58.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  25 
 
 		 787 aa  58.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  28.66 
 
 		 3324 aa  58.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.39 
 
 		 1295 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  40.4 
 
 		 915 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.49 
 
 		 630 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1032 aa  57.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.64 
 
 		 794 aa  57.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  35.24 
 
 		 2278 aa  57  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  26.68 
 
 		 2520 aa  55.5  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1321 aa  55.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 1343 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  24.33 
 
 		 808 aa  54.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1440 aa  54.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1245 aa  53.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  25.63 
 
 		 910 aa  53.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 		 5010 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 757 aa  53.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 983 aa  53.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1303 aa  53.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  36.14 
 
 		 827 aa  53.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  36.59 
 
 		 644 aa  53.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.33 
 
 		 14944 aa  53.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.21 
 
 		 5017 aa  52.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.21 
 
 		 5017 aa  52.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.08 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25 
 
 		 2121 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  34.92 
 
 		 5017 aa  52  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  25.32 
 
 		 3921 aa  51.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  22.3 
 
 		 1606 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  34.92 
 
 		 5017 aa  50.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 		 1989 aa  50.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1547 aa  50.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  28.53 
 
 		 942 aa  49.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 		 5010 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.41 
 
 		 5010 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  34.65 
 
 		 801 aa  49.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  23.62 
 
 		 842 aa  48.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 2573 aa  48.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>