34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0981 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  967    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  27.84 
 
 
1100 aa  90.1  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.14 
 
 
1657 aa  87  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.42 
 
 
792 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.16 
 
 
822 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.05 
 
 
1329 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.96 
 
 
2713 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  24.93 
 
 
1750 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28 
 
 
1266 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  24.36 
 
 
636 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.98 
 
 
3793 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.49 
 
 
1288 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  27.16 
 
 
1345 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  29.05 
 
 
925 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  28.94 
 
 
1247 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.25 
 
 
991 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.51 
 
 
2833 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  28.7 
 
 
1108 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  27.07 
 
 
1170 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  34.31 
 
 
1160 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.69 
 
 
1507 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  34.62 
 
 
815 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  22.83 
 
 
561 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.83 
 
 
2270 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.25 
 
 
1607 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  32.89 
 
 
6497 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  34.43 
 
 
1748 aa  47  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.85 
 
 
1969 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.55 
 
 
4071 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30.51 
 
 
1275 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  36.36 
 
 
637 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  24.91 
 
 
657 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  22.32 
 
 
1059 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
1343 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>