156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2423 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  53.37 
 
 		 1060 aa  1117    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 1044 aa  2124    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  47.1 
 
 		 1021 aa  918    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  41.58 
 
 		 1048 aa  734    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1043 aa  942    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 1078 aa  952    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  56.1 
 
 		 1032 aa  1206    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  47.88 
 
 		 1060 aa  945    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  48.17 
 
 		 1063 aa  982    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  40.66 
 
 		 999 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  46.72 
 
 		 931 aa  841    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.76 
 
 		 1082 aa  894    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1054 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.19 
 
 		 1041 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  34.08 
 
 		 1075 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1147 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  30.83 
 
 		 1084 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1090 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 983 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  27.79 
 
 		 952 aa  319  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26 
 
 		 681 aa  184  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1220 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.22 
 
 		 912 aa  141  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  23.12 
 
 		 1083 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.84 
 
 		 652 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.12 
 
 		 630 aa  115  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1117 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.83 
 
 		 694 aa  95.5  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  30.04 
 
 		 608 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1321 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.32 
 
 		 597 aa  77  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26 
 
 		 780 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.11 
 
 		 1750 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.55 
 
 		 909 aa  73.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  26.45 
 
 		 931 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  27.05 
 
 		 361 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  25.08 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  26.69 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  26.69 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  29.72 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  27.11 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  27.44 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.47 
 
 		 345 aa  62  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.47 
 
 		 345 aa  62  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  23.48 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 357 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  27.76 
 
 		 910 aa  60.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  27.85 
 
 		 343 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  23.81 
 
 		 1305 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  26.73 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  26.09 
 
 		 876 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  27.18 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  28.1 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  24.17 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  28.14 
 
 		 931 aa  58.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  27.56 
 
 		 934 aa  58.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.5 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  25.96 
 
 		 913 aa  57.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.16 
 
 		 393 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  25.38 
 
 		 1904 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  24.71 
 
 		 357 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  27.78 
 
 		 357 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  25.82 
 
 		 279 aa  55.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 350 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  25.58 
 
 		 357 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.71 
 
 		 385 aa  55.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.12 
 
 		 357 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  24.03 
 
 		 347 aa  54.7  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2143  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30 
 
 		 581 aa  54.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  27.33 
 
 		 341 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  24.91 
 
 		 367 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.79 
 
 		 361 aa  54.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  28.35 
 
 		 385 aa  54.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  24.27 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  26.95 
 
 		 911 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 479 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  24.51 
 
 		 464 aa  53.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.54 
 
 		 381 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  26.8 
 
 		 368 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  23.14 
 
 		 373 aa  53.5  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  21.05 
 
 		 876 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.54 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  24.22 
 
 		 925 aa  52.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  26.13 
 
 		 404 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  26.13 
 
 		 404 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.9 
 
 		 361 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.78 
 
 		 357 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.05 
 
 		 359 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>