145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2149 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  100 
 
 		 1108 aa  2201    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  52.09 
 
 		 1288 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  47.08 
 
 		 1657 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  41.03 
 
 		 1266 aa  311  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  49.38 
 
 		 1748 aa  293  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  44.3 
 
 		 3793 aa  292  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  47.13 
 
 		 815 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  39.19 
 
 		 991 aa  267  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  48.06 
 
 		 1247 aa  263  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1329 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  46.98 
 
 		 1160 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  37.53 
 
 		 2713 aa  208  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  39.25 
 
 		 2270 aa  206  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  41.31 
 
 		 1275 aa  204  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  45.87 
 
 		 1474 aa  193  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  45.98 
 
 		 1585 aa  191  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  46.21 
 
 		 1217 aa  191  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1547 aa  163  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1969 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  43.87 
 
 		 1002 aa  154  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  53.81 
 
 		 1414 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  41.92 
 
 		 1295 aa  141  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  31.69 
 
 		 2278 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2378  hypothetical protein  30.04 
 
 		 417 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.090996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.04 
 
 		 1607 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.68 
 
 		 1750 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1386 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  29.36 
 
 		 989 aa  112  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.49 
 
 		 1507 aa  112  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  34.08 
 
 		 4071 aa  111  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.43 
 
 		 1068 aa  111  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1303 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.96 
 
 		 1345 aa  104  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1228 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.99 
 
 		 4978 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.63 
 
 		 2833 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1287 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  31.62 
 
 		 2402 aa  92.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.09 
 
 		 822 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.05 
 
 		 794 aa  88.2  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  32.56 
 
 		 2262 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.92 
 
 		 3542 aa  85.5  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1313 aa  84.7  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.88 
 
 		 1343 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.37 
 
 		 3324 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.93 
 
 		 799 aa  84  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1100 aa  82.8  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  34.06 
 
 		 1079 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  27.76 
 
 		 925 aa  82  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.34 
 
 		 2272 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  24.55 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1976 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  44.59 
 
 		 1302 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2148  polysaccharide lyase polysaccharide lyase family 14 protein  40.45 
 
 		 356 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  32.04 
 
 		 2416 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.19 
 
 		 5453 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 		 4429 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1488 aa  72.4  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  31.05 
 
 		 2418 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  28.82 
 
 		 483 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  31.45 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2285  hypothetical protein  26.65 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.306055  hitchhiker  0.000423309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.05 
 
 		 14944 aa  68.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  30.9 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.92 
 
 		 1620 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.45 
 
 		 2367 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 734 aa  66.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.67 
 
 		 1222 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.83 
 
 		 1771 aa  64.7  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.94 
 
 		 1783 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  28.15 
 
 		 2024 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1243 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  30.65 
 
 		 691 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 5298 aa  62.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  31.24 
 
 		 904 aa  62.4  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1804 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1980 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.22 
 
 		 978 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.38 
 
 		 1483 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.03 
 
 		 890 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2421 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  26.52 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.94 
 
 		 2411 aa  58.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  26.36 
 
 		 2005 aa  58.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.89 
 
 		 1679 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.22 
 
 		 636 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  29.96 
 
 		 6497 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  40.91 
 
 		 2042 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  40.48 
 
 		 4896 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.72 
 
 		 627 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.41 
 
 		 886 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  26.32 
 
 		 1170 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1245 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  23.81 
 
 		 541 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.03 
 
 		 5544 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  22.31 
 
 		 938 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1111 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  27.39 
 
 		 1387 aa  52  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>